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1982年马大正主任大学毕业后分配到温州市中医院,开始从事中医妇科的临床工作,这才是他真正意义的中医临床工作的开始。今后的道路是多么的漫长,任务是多么的艰难,他感到任重而道远。1983年他成为浙江省卫生厅指定的高级中医师吴国栋主任的学术继承人,在为期3年的伺诊学习中,他学到了老师诊治妇科疾病尤其是独具匠心运用一些经方治疗妇科疾病的经验。此后,他还进修了西医妇科。
自从独立门诊之后,工作时有闲暇,马主任发现时至今日我国还没有一部中国妇产科发展史的专著,便立志要充分利用这段时间,博览群书,搜罗资料,著书立说,填补此空白。通过八年的刻苦努力,参考文献达200多种,从经(如《十三经注疏》等),史(如《廿四史》、《唐会要》、《元典章》、《清史稿》等),子(如《内》、《难》、《本草经》、《伤寒论》、《甲乙经》、《小品方》、《脉经》、《脉诀》、《圣惠方》、《局方》、《圣济总录》和历代妇科代表著作等),集(如《诗经》、《阅微草堂笔记》、《履园丛话》、《搜神志》、《拾遗志》、《梦梁录》、《京华梦华录》、《南村辍耕录》等),考古(如《马王堆汉墓帛书》、《武威汉代医简》、《睡虎地秦墓竹简》等),哲学(如《中国传统思想总批判》等),典志(如《释名疏证补》、《说文解字》、《中国医藉考》、《中国医学人名志》、《中国图书联合目录》、《两浙著述考》、《中国分省医藉考》、《中国医史年表》等),近人史学著作(如《中国古代法医学史》、《中国史话》、《吕思勉读史札记》、《中国女性史》、《李亚农史论集》、《中国婚姻史》等)各方面对我国妇产科的发展史作一番深入系统的挖掘和总结,于1991年完成出版21万字的《中国妇产科发展史》。该书以断代史的形式分述各个历史时期的妇产科学,诸凡历史背景、妇产科发展的原因,以及妇产科医家、医著、理论与临床进展等内容,并由广东中医药大学著名教授、博士生导师罗元恺和广西中医学院硕士生导师班秀文教授作序。罗教授说:“马君此书内容丰富而全面,弥补了中医学科的一个空白点,自会受到医学界的重视”。此书出版后,立即引起社会的重视,《中华医史杂志》对此书发表专评文章,国内医史学界纷纷来函祝贺。美国南加州大学历史教授Charlotte Furth在1999年出版的著作《繁盛之阴:中国医学史中的性别,960—1665》的“鸣谢”中说:“我从许多历史学者的著作中获益,其中一本马大正的《中国妇产科发展史》尤为杰出,它兼备了临床与学术的眼光。关于这些著作的完整目录您将在后面的参考书目中找到,但这些枯燥的条目并不能完全反映他们所做出的重要贡献。这本著作虽然是中国政府推广中医学术的成果,但很大一部分是在很困难的物质条件下完成的。做任何严肃的学术研究,都需要对中国博大精深的中医文化有一个基本认识,若没有这本书,对于像我这样的门外汉来说,简直是不可能的。”书中援引《发展史》达30多处。该书还在美国的南加州大学、耶鲁大学,日本的顺天堂大学、北里研究所附属东洋医学研究所,法国的东方语言学院,德国的基尔大学,英国的剑桥大学李约瑟研究所,韩国的庆熙大学,香港的中文大学、浸会大学以及美国国会图书馆中陈列。此时此刻,马主任的临床业务已经十分繁忙,但他仍不断思考探索,发现初步妇科临床的医师用药拘谨局限,不识众药之妙,常常出现笔下无药的窘境,他查检372种医学文献,69种医学期刊,从专科的角度对中药的功效作系统的研究、总结,于1992年编写出版50万字的《中医妇科临床药物手册》,开辟了编著专科药物学的先河。
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